分子也能剪？能！就有这么一把“剪刀”——新芝超声波DNA打断仪

作者：新芝生物　发布日期：2022-09-24

随着下一代测序（Next-generation sequencing，NGS）技术的发展与成熟，在科研、诊断、体检各市场领域的应用范围不断扩大。如今，随着市场不断发展，测序技术自身开发速度却逐渐放缓，样品制备在NGS中的瓶颈效应越来越明显，以缩短时间、提高通量为主要目标的新试剂、新仪器不断涌现。同时，聚焦于样本的更小处理体积的新方法也在不断开发，但在NGS文库构建的过程中，DNA片段化始终是一个无法避开的步骤。

▲NGS高通量测序基本流程

Basicprocess for high-throughput sequencing NGS

对长链DNA（通常指生物染色体DNA）片段化的主要原因是短链DNA片段有利于进行DNA分子快速杂交和高灵敏目标检测，可显著提升测序效率。目前，常用的染色体脱氧核糖核酸（Deoxyribonucleic acid， DNA）分子片段化方法主要有四种，分别为：DNA限制性酶切法、水动力剪切法、超声波断裂法、喷射雾化法，四种方法各有利弊。

▲DNA分子结构形态

Molecularstructure and morphology of DNA

超声打断基于水动力剪切法和超声波断裂法，是最常见的DNA片段化方式。其原理为：液体在高频率的脉冲作用下，产生无数的高压点和低压点，伴随产生的空化泡存在几毫秒又因压力变化而爆破，在这个过程中液体内形成瞬时高强度剪切力，这种作用力可以破碎细胞、影响蛋白质和剪切DNA。在此特别推荐新芝生物的一款特色产品：SCIENTZ18-A超声波DNA打断仪，采用非接触式的工作方式，单次最高处理量可达12个样品，是染色质免疫共沉淀（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）和DNA剪切研究平台的标准化工具。